{"id":8932,"date":"2019-06-27T13:31:26","date_gmt":"2019-06-27T11:31:26","guid":{"rendered":"http:\/\/www.sigterritoires.fr\/?p=8932"},"modified":"2019-09-18T11:16:30","modified_gmt":"2019-09-18T09:16:30","slug":"qgis-3-8-hotspot-analysis-plugin-et-pysal","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.sigterritoires.fr\/index.php\/qgis-3-8-hotspot-analysis-plugin-et-pysal\/","title":{"rendered":"QGis 3.8, HotSpot Analysis Plugin et PySal"},"content":{"rendered":"\n

Tout d’abord, la date: on est le 26 juin 2019.<\/p>\n\n\n\n

J’ai eu des probl\u00e8mes pour installer le plugin HotSpot Analysis et le plus dur quand on cherche sur le net c’est qu’on tombe pelle m\u00eale sur des solutions du mois dernier et d’il y a 10 ans. Mais il faut un travail de d\u00e9tective pour savoir de quand elles datent.<\/p>\n\n\n\n

Donc, si vous \u00eates en 2025, il est fort probable que les solutions que je propose dans cet article ne soient plus les bonnes…<\/p>\n\n\n\n

Le plugin HotSpot Analysis est une bonne alternative pour la cartographie<\/a> d’auto-correlations spatiales. Par contre, il souffre, actuellement d’un manque de \u00ab\u00a0finition\u00a0\u00bb dans son processus d’installation et d’un petit retard de maintenance.<\/p>\n\n\n\n

Installation dans QGis 3.8<\/h2>\n\n\n\n

Si vous allez dans la fen\u00eatre d’installation des extensions, lisez bien le texte:<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Ce n’est pas comme d’habitude, un clic sur Installer l’extension et puis c’est pr\u00eat.<\/p>\n\n\n\n

Il faut commencer par v\u00e9rifier si vous avez d\u00e9j\u00e0 le paquet PySal dans votre installation Python. Si ce n’est pas le cas, il faudra l’installer avant d’installer le plugin HotSpot Analysis.<\/p>\n\n\n\n

Pour savoir si PySal est Install\u00e9, ouvrez la console Python (Extension->Console Python)<\/p>\n\n\n\n

Tapez apr\u00e8s >>> import pysal<\/p>\n\n\n\n

Si vous n’avez pas de message d’erreur, le paquet est install\u00e9. Si non, vous aurez:<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Installer un paquet Python pour QGis<\/h2>\n\n\n\n

Fermez QGis. L’installation doit se faire en dehors. Dans la fen\u00eatre de programmes, sous la rubrique QGis vous trouverez le programme OSGeo4W Shell.<\/p>\n\n\n\n

Ce programme ouvre une fen\u00eatre de commandes. Il faut l’ex\u00e9cuter en tant qu’administrateur, donc, cliquez droit sur le OSGeo4W Shell->plus->Ouvrir l’emplacement du fichier<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Clic droit sur le nom du fichier->Ex\u00e9cuter en tant qu’administrateur<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Si c’est la premi\u00e8re fois que vous installez un paquet il se peut que la commande pip<\/strong>, n\u00e9cessaire pour l’installation, ne soit pas d\u00e9j\u00e0 install\u00e9e .<\/p>\n\n\n\n

Pour l’installer tapez:<\/p>\n\n\n\n

curl https:\/\/bootstrap.pypa.io\/get-pip.py -o get-pip.py<\/strong><\/p>\n\n\n\n

puis:<\/p>\n\n\n\n

python get-pip.py<\/strong><\/p>\n\n\n\n

On peut maintenant installer le paquet pysal dans votre installation Python:<\/p>\n\n\n\n

pip install pysal<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Mais ce n’est pas tout, il faut aussi installer pysal dans l’environnement Python3 pour pouvoir l’utiliser.<\/p>\n\n\n\n

Tapez:<\/p>\n\n\n\n

py3_env<\/strong><\/p>\n\n\n\n

pour passer dans l’environnement PYthon3, puis:<\/p>\n\n\n\n

pip install pysal<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Fermez la fen\u00eatre de commande et relancez QGis. On va v\u00e9rifier si l’installation du paquet s’est bien pass\u00e9e ou s’il faut la r\u00e9installer avec certaines options.<\/p>\n\n\n\n

Ouvrez la fen\u00eatre de console Python et tapez<\/p>\n\n\n\n

>>>import pysal<\/p>\n\n\n\n

S’il n’y a pas d’erreur, vous avez fini. Par contre s’il y a toujours la m\u00eame erreur il faut r\u00e9installer le paquet:<\/p>\n\n\n\n

Ouvrez la fen\u00eatre Shell comme d\u00e9crit ci-dessus et rentrez, une \u00e0 une les lignes suivantes, en r\u00e9pondant \u00ab\u00a0Y\u00a0\u00bb \u00e0 la question pos\u00e9e:<\/p>\n\n\n\n

python get-pip.py
pip uninstall pysal
pip install –no-cache-dir pysal<\/strong>
py3_env
pip uninstall pysal
pip install –no-cache-dir pysal<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Fermez la fen\u00eatre de Shell et relancez QGis. cette fois le paquet pysal devrait \u00eatre charg\u00e9 sans erreur.<\/p>\n\n\n\n

Installation du plugin<\/h2>\n\n\n\n

Une fois que vous aurez cliqu\u00e9 sur Installer le plugin , vous aurez la mauvaise surprise d’avoir un message d’erreur, du type:<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Ceci est du au fait que la biblioth\u00e8que pysal a subi des modifications est que les concepteurs du plugin ne l’ont pas encore mis \u00e0 jour.<\/p>\n\n\n\n

Si vous ne l’avez pas, c’est qu’ils ont mis \u00e0 jour le plugin.<\/p>\n\n\n\n

Pour l’instant, il faut utiliser une solution de contournement un peu fastidieuse.<\/p>\n\n\n\n

Il faut modifier le fichier hotspot_analysis.py<\/code> situ\u00e9 dans le r\u00e9pertoire C:\\Users\\USER\\AppData\\Roaming\\QGIS\\QGIS3\\profiles\\default\\python\\plugins\\HotspotAnalysis<\/p>\n\n\n\n

Il faut remplacer une s\u00e9rie de lignes de code. (Le num\u00e9ro de ligne ici n’est pas forc\u00e9ment le m\u00eame que celui de votre installation)<\/p>\n\n\n\n

Line 39 from pysal.esda.getisord import *\nLine 40 from pysal.esda.moran import *\nLine 41 from pysal.weights.Distance import DistanceBand\n.\nLine 472 thresh = pysal.min_threshold_dist_from_shapefile(path)\n.\nLine 600 moran = pysal.Moran(y, w)\n.\nLine 608 w = pysal.knnW_from_shapefile(layerName.split(\"|\")[0], k=weightValue, p=1)\n.\nLine 613 w = pysal.queen_from_shapefile(layerName.split(\"|\")[0])<\/code><\/pre>\n\n\n\n
Les trois premi\u00e8res lignes doivent \u00eatre remplac\u00e9es par:<\/p>\n\n\n\n
from pysal.explore.esda.getisord import *\nfrom pysal.explore.esda.moran import *\nfrom pysal.lib.weights import DistanceBand, Queen, KNN, user<\/code><\/pre>\n\n\n\n
La ligne ~472 par<\/p>\n\n\n\n
thresh = user.min_threshold_dist_from_shapefile(path)<\/code><\/pre>\n\n\n\n
La ligne ~600 par<\/p>\n\n\n\n
moran = Moran(y, w)<\/code><\/pre>\n\n\n\n
La ligne ~608 par<\/p>\n\n\n\n
w = KNN.from_shapefile(layerName.split(\"|\")[0], k=weightValue, p=1)<\/code><\/pre>\n\n\n\n
Et enfin la ligne ~613 par<\/p>\n\n\n\n
w = Queen.from_shapefile(layerName.split(\"|\")[0])<\/code><\/pre>\n\n\n\n
Redemarrez QGis.<\/p>\n\n\n\n
Allez dans Vecteur->HotSpot Analysis et vous verrez enfin appara\u00eetre la fen\u00eatre du plugin. N’oubliez pas de charger une couche de points avec un attribut num\u00e9rique, si non la fen\u00eatre ne s’ouvre pas, sans afficher aucun message…<\/p>\n\n\n\n
\"\"<\/a><\/figure>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
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